How SciFinder handles explicitly drawn hydrogen atoms with structure searching

Tony Machosky (CAS) on substructure searching in SciFinder:

According to  CAS technical experts, only hydrogen atoms with no attachments are completely ignored by the SciFinder Smartsearch function.  An
explicit hydrogen on a non-metal atom (or hydrogen in a shortcut such as CH2) may be satisfied by:

– A hydrogen on the matching atom
– A hydrogen on an atom in a tautomer, including keto-enol tautomers and some extended tautomers
– A charge (query CO2H matches CO2¯)
– A bond to a metal, typically in a coordination compound

The first precision analyze candidate includes only answers where each query hydrogen is matched to a hydrogen on the matching atom or on an atom
in a heteroatom tautomer.


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